Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNCP24863 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNCP24863 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNCP24863 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms