Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCHP24723 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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