Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPREP23469 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPREP23469 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPREP23469 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTPREP23469 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTPREP23469 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPREP23469 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PTPREP23469 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
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PTPREP23469 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PTPREP23469 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PTPREP23469 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PTPREP23469 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPREP23469 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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