Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRDP23468 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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