Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4BPBP20851 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4BPBP20851 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms