Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NTF3P20783 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NTF3P20783 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NTF3P20783 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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