Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms