Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATF1P18846 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF1P18846 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF1P18846 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms