Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PDE6GP18545 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PDE6GP18545 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PDE6GP18545 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PDE6GP18545 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PDE6GP18545 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PDE6GP18545 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PDE6GP18545 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PDE6GP18545 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PDE6GP18545 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PDE6GP18545 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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