Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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