Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms