Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms