Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSP16219 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSP16219 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSP16219 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms