Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms