Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL2P13500 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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