Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms