Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms