Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA5P08648 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms