Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB1P04280 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRB1P04280 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRB1P04280 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRB1P04280 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRB1P04280 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB1P04280 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB1P04280 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB1P04280 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB1P04280 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB1P04280 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB1P04280 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB1P04280 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB1P04280 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB1P04280 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms