Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV3-15P01624 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV3-15P01624 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms