Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms