Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATE1O95260 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATE1O95260 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATE1O95260 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATE1O95260 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATE1O95260 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATE1O95260 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATE1O95260 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATE1O95260 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATE1O95260 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms