Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NEBLO76041 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NEBLO76041 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEBLO76041 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEBLO76041 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms