Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COCHO43405 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COCHO43405 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COCHO43405 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COCHO43405 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COCHO43405 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COCHO43405 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COCHO43405 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COCHO43405 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COCHO43405 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms