Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms