Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms