Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFFAO00273 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DFFAO00273 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DFFAO00273 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DFFAO00273 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DFFAO00273 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms