Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms