Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms