Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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