Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDR42E2A6NKP2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms