Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM247A6NEH6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms