Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms