Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUBP2Q9Y5Y2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms