Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP16Q9Y5T5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms