Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAI2Q9Y5P3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms