Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TNPO3Q9Y5L0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms