Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms