Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms