Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR55Q9Y2T6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms