Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms