Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms