Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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USP18Q9UMW8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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