Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms