Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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