Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms