Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms