Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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