Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CFDP1Q9UEE9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms