Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NLKQ9UBE8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms